Однако при противоточной регенерации для полной десорбции ионов натрия требуется намного больший расход реагентов, поэтому данную схему применяют при работе с водой, содержащей в малых количествах ионы натрия, или для умягчения воды. Проведение противоточной регенерации существенно усложняется наличием устройства для сохранения неподвижности слоя катионита при подаче раствора снизу вверх.
Образующийся при Н-катионировании диоксид углерода удаляется из воды аэрированием, которое проводят, как правило, с помощью вентиляторных градирен с насадками из деревянных реек или полых кислотоупорных керамических цилиндров (колец Рашига).