Потоки воды выносят газы в камеру газоотделения. Процесс газоотделения в данном случае аналогичен процессу деаэрирования воды: при ее нагревании на сильно развитой поверхности насадки происходит выделение из воды растворяемых газов и в первую очередь продуктов электролиза (водорода). Выделившийся газ скапливается в конусной полости и отводится периодически или непрерывно через клапан.

Одновременно в объеме насадки идет хлопьеобразование (флокуляция) и осаждение образовавшихся агрегатов на поверхности насадки. Освободившаяся от газов и частично от хлопьев вода через перфорированное дно патрубка выходит из электрокоагулятора и поступает на дальнейшую обработку, например, на осветлительный фильтр. Периодическая промывка электрокоагулятора производится противотоком воды при отключенном электропитании.

Оборудование для очистки воды в магнитном поле имеет, как правило, сходный набор конструктивных элементов: корпус, рабочую камеру, источник постоянного или переменного магнитного поля, средства для интенсификации процесса омагничивания воды, приспособления для регенерации фильтра и др. В аппаратах используются разнообразные магнитные поля (однородное, неоднородное, постоянное, электромагнитное и др.), которые воздействуют на протекающую через камеру жидкость, например загрязненную воду.